Hoxd3

All Motif List Score Matrix

Logo

Position Weight Matrix

Position	A	C	G	T
1	0.19	0.37	0.05	0.39
2	0.19	0.08	0.08	0.65
3	0.14	0.1	0.6	0.16
4	0.366	0.099	0.327	0.208
5	0.238	0.089	0.436	0.238
6	0.14	0.24	0.29	0.33
7	0.01	0.141	0.0	0.848
8	0.879	0.121	0.0	0.0
9	0.98	0.01	0.0	0.01
10	0.01	0.0	0.01	0.98
11	0.0	0.0	0.121	0.879
12	0.848	0.0	0.141	0.01
13	0.374	0.374	0.141	0.111
14	0.238	0.436	0.089	0.238
15	0.119	0.366	0.307	0.208
16	0.09	0.22	0.21	0.48

Download Position Weight Matrix

Related Motifs

	Hoxd3	Hoxb5	LHX1	LHX5	Arx	Alx1	Alx4	Lhx3	HOXD10	Hoxd8
Hoxd3	100	95	86	86	84	82	81	73	70	66
Hoxb5	95	100	82	82	81	81	79	65	62	23
LHX1	86	82	100	100	-22	25	23	74	35	78
LHX5	86	82	100	100	-22	25	23	74	35	78
Arx	84	81	-22	-22	100	90	90	83	67	82
Alx1	82	81	25	25	90	100	98	75	66	78
Alx4	81	79	23	23	90	98	100	82	64	78
Lhx3	73	65	74	74	83	75	82	100	35	71
HOXD10	70	62	35	35	67	66	64	35	100	23
Hoxd8	66	23	78	78	82	78	78	71	23	100