HOX-related_factors_5_merged

Logo

Position	A	C	G	T
1	0.5	0.22	0.18	0.1
2	0.239	0.328	0.278	0.154
3	0.203	0.089	0.54	0.168
4	0.116	0.146	0.377	0.362
5	0.01	0.106	0.0	0.884
6	0.894	0.106	0.0	0.0
7	0.98	0.01	0.0	0.01
8	0.01	0.0	0.01	0.98
9	0.0	0.0	0.106	0.894
10	0.884	0.0	0.106	0.01
11	0.26	0.29	0.325	0.125
12	0.168	0.54	0.089	0.203
13	0.245	0.29	0.1	0.365
14	0.22	0.52	0.105	0.155
15	0.662	0.065	0.109	0.164
16	0.305	0.105	0.255	0.335

Motif Name	Full Motif Name	Logo	PWM
Hoxb5	Hoxb5		Download
Hoxd3	Hoxd3		Download

	Hoxb5	Hoxd3	LHX1	LHX5	Arx	Alx1	Alx4	PHOX2A	Phox2b	POU3F3
Hoxb5	100	95	82	82	81	81	79	71	70	68
Hoxd3	95	100	86	86	84	82	81	24	21	10
LHX1	82	86	100	100	-22	25	23	-3	-5	14
LHX5	82	86	100	100	-22	25	23	-3	-5	14
Arx	81	84	-22	-22	100	90	90	70	69	25
Alx1	81	82	25	25	90	100	98	68	66	20
Alx4	79	81	23	23	90	98	100	69	67	20
PHOX2A	71	24	-3	-3	70	68	69	100	99	59
Phox2b	70	21	-5	-5	69	66	67	99	100	59
POU3F3	68	10	14	14	25	20	20	59	59	100