AIRE

All Motif List Score Matrix

Logo

Position Weight Matrix

Position	A	C	G	T
1	0.398	0.261	0.125	0.216
2	0.182	0.182	0.136	0.5
3	0.136	0.136	0.205	0.523
4	0.045	0.0	0.886	0.068
5	0.0	0.0	0.818	0.182
6	0.318	0.045	0.023	0.614
7	0.386	0.091	0.023	0.5
8	0.364	0.136	0.136	0.364
9	0.341	0.068	0.136	0.455
10	0.523	0.091	0.136	0.25
11	0.386	0.045	0.068	0.5
12	0.227	0.136	0.068	0.568
13	0.0	0.023	0.886	0.091
14	0.0	0.0	0.977	0.023
15	0.227	0.091	0.25	0.432
16	0.068	0.182	0.182	0.568
17	0.455	0.023	0.159	0.364
18	0.403	0.267	0.108	0.222

Download Position Weight Matrix

Related Motifs

	AIRE	RFX4	RFX3	RHOXF1	RORA(var.2)	NR1D1	Rfx1	MXI1_var2	HOMEZ	RORC
AIRE	100	50	49	47	47	47	46	46	46	44
RFX4	50	100	98	4	0	21	91	91	23	20
RFX3	49	98	100	9	0	19	93	92	22	17
RHOXF1	47	4	9	100	18	10	0	11	29	18
RORA(var.2)	47	0	0	18	100	96	17	-7	25	93
NR1D1	47	21	19	10	96	100	16	5	30	92
Rfx1	46	91	93	0	17	16	100	97	10	15
MXI1_var2	46	91	92	11	-7	5	97	100	7	-8
HOMEZ	46	23	22	29	25	30	10	7	100	19
RORC	44	20	17	18	93	92	15	-8	19	100