LIN54

All Motif List Score Matrix

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Position Weight Matrix

Position	A	C	G	T
1	0.411	0.091	0.212	0.285
2	0.0	0.0	0.0	1.0
3	0.0	0.0	0.0	1.0
4	0.0	0.212	0.0	0.788
5	0.438	0.0	0.562	0.0
6	1.0	0.0	0.0	0.0
7	1.0	0.0	0.0	0.0
8	0.104	0.211	0.0	0.685
9	0.243	0.249	0.159	0.35

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Related Motifs

	LIN54	POU5F1B	HSFY2_var2	POU3F4	Hoxd9	POU2F1	NFAT5	TBX10	FOXB2	HOXD13
LIN54	100	71	69	63	57	57	57	55	55	54
POU5F1B	71	100	38	98	38	97	67	30	69	34
HSFY2_var2	69	38	100	35	28	-6	51	1	24	27
POU3F4	63	98	35	100	30	97	63	26	67	27
Hoxd9	57	38	28	30	100	16	35	29	43	90
POU2F1	57	97	-6	97	16	100	18	40	66	18
NFAT5	57	67	51	63	35	18	100	22	26	35
TBX10	55	30	1	26	29	40	22	100	53	24
FOXB2	55	69	24	67	43	66	26	53	100	44
HOXD13	54	34	27	27	90	18	35	24	44	100