HOXA7

All Motif List Score Matrix

Logo

Position Weight Matrix

Position	A	C	G	T
1	0.166	0.172	0.278	0.384
2	0.106	0.529	0.153	0.212
3	0.0	0.635	0.153	0.212
4	0.894	0.053	0.0	0.053
5	0.682	0.212	0.106	0.0
6	0.0	0.106	0.1	0.794
7	0.106	0.841	0.053	0.0
8	0.159	0.0	0.318	0.524
9	0.529	0.159	0.153	0.159
10	0.106	0.0	0.159	0.735
11	0.159	0.265	0.159	0.418
12	0.106	0.053	0.688	0.153
13	0.735	0.0	0.053	0.212
14	0.159	0.053	0.265	0.524
15	0.093	0.304	0.246	0.357

Download Position Weight Matrix

Related Motifs

	HOXA7	HBP1	HSFY2_var3	CUX1	HSFY1	HSFY2	SOX9	CUX2	PBX2	Arid5a
HOXA7	100	56	53	53	52	52	51	51	49	48
HBP1	56	100	-12	26	-12	-12	36	25	31	36
HSFY2_var3	53	-12	100	-11	98	98	18	-11	21	0
CUX1	53	26	-11	100	-10	-10	63	99	-5	51
HSFY1	52	-12	98	-10	100	100	14	-8	15	3
HSFY2	52	-12	98	-10	100	100	14	-8	15	3
SOX9	51	36	18	63	14	14	100	60	0	-9
CUX2	51	25	-11	99	-8	-8	60	100	-4	17
PBX2	49	31	21	-5	15	15	0	-4	100	18
Arid5a	48	36	0	51	3	3	-9	17	18	100