SOX18_var4

All Motif List Score Matrix

Logo

Position Weight Matrix

Position	A	C	G	T
1	0.065	0.065	0.805	0.065
2	0.247	0.123	0.63	0.0
3	0.63	0.123	0.247	0.0
4	0.384	0.37	0.123	0.123
5	0.384	0.123	0.37	0.123
6	0.63	0.0	0.123	0.247
7	0.26	0.247	0.37	0.123
8	0.616	0.0	0.26	0.123
9	0.753	0.0	0.0	0.247
10	0.0	1.0	0.0	0.0
11	1.0	0.0	0.0	0.0
12	1.0	0.0	0.0	0.0
13	0.37	0.0	0.0	0.63
14	0.0	0.123	0.493	0.384
15	0.123	0.247	0.384	0.247
16	0.247	0.123	0.37	0.26
17	0.37	0.123	0.0	0.507
18	0.247	0.0	0.37	0.384
19	0.031	0.538	0.277	0.154

Download Position Weight Matrix

Related Motifs

	SOX18_var4	LEF1	NR1H2::RXRA	NFYC	Nr5a2	Rxra	RXRG	DMRT2	Alx1	NR6A1
SOX18_var4	100	63	50	47	44	42	42	42	41	41
LEF1	63	100	72	2	53	63	63	12	24	18
NR1H2::RXRA	50	72	100	17	61	92	89	22	15	53
NFYC	47	2	17	100	36	35	35	25	49	-6
Nr5a2	44	53	61	36	100	43	44	21	-5	5
Rxra	42	63	92	35	43	100	99	10	7	2
RXRG	42	63	89	35	44	99	100	11	7	3
DMRT2	42	12	22	25	21	10	11	100	13	10
Alx1	41	24	15	49	-5	7	7	13	100	-4
NR6A1	41	18	53	-6	5	2	3	10	-4	100